Derzeit fliegt CityJet noch mit 13 Bombardier CRJ-900 wie der EI-GEC im Wetlease für SAS. Die Flugzeuge dieser Zusammenarbeit sind überwiegend ganz in Weiss mit einem winzigen Sticker neben der Passagiertüre oder vereinzelt in neutralisierten SAS-Farben unterwegs. Sie kommen sowohl innereuropäisch wie auch innerhalb Skandinaviens zum Einsatz.
Die 22 noch aktiven Bombardier CRJ-900ER der Lufthansa CityLine, hier die aktuell noch genutzte D-ACNA, sind nicht nur in die Jahre gekommen, sondern angesichts der Treibstoffpreise, die sich verdoppelt haben, laut Lufthansa nicht mehr wirtschaftlich zu betreiben. Deshalb erfolgt ihre Ausserdienststellung zum 18.4.26.
Im aktuellen Design der Konzernmutter zeigt sich die Bombardier CRJ-900LR D-ACND «Meersburg», die momentan noch für Lufthansa CityLine im regelmässigen Einsatz steht.
Nach dem Wegfallen der Lufthansa Regional-Marke erhielt die von Lufthansa CityLine betriebene Bombardier CRJ-900 D-ACKJ die Aufschriften der Konzernmutter, der sie als Zubringer dient.
Lufthansa wird im Sommer 2025 die Bedienung ihrer Strecken nach Genf gruppenintern an Swiss International Air Lines abgeben. Damit werden die Canadair RJ-900LR der Lufthansa CityLine wie die D-ACNL nicht mehr am Flughafen der Rhône-Stadt zu sehen sein.
Der Canadair Regional Jet 900LR D-ACNN wurde im April 2010 ursprünglich an Eurowings ausgeliefert. Im November 2016 wurde er in die Flotte von Lufthansa CityLine integriert.
Im Frühling 2019 übernahm Uganda Airlines als erste eigene Flugzeuge zwei CRJ-900LR direkt ab Werk, eine davon war die 5X-EQU. Zwei weitere Einheiten folgten im Herbst desselben Jahres. Ausserdem betreibt der Flagcarrier des zentralafrikanischen Staates seit dem Jahreswechsel 2020/21 auch noch zwei Airbus A330-841.
Die D-ACNC der Lufthansa CityLine auf dem Weg zur RWY28. Neben der D-ACNC betreibt die Lufthansa weitere 22 Maschinen des Types CRJ-900, welche ab März nun auch auf der Strecke FRA-RZE eingesetzt werden.
Gleich mehrere untrennbar mit Lufthansa verbundene Marken prangen unübersehbar auf der Bombardier CRJ-700 D-ACPS, die von Lufthansa CityLine unter der Lufthansa Regional Marke im Verbund der Star Alliance betrieben wird.